Nucleic Acids Research  (IF=16.971) 2021-07-21

巴黎计算与定量生物学实验室 Olivier Vallon和Zhou Xu课题组

在大多数真核生物中，亚端粒是由不同来源的多拷贝序列组成的动态基因组区域，可以促进节段重复和染色体重排。然而，它们的重复性使得对它们进行排序、分析它们的结构和推断它们如何进化的工作变得复杂。在这里，我们使用最近基于长读长测序的莱茵衣藻基因组组装来全面描述该模型单细胞绿藻的 17 条染色体的亚端粒结构。我们确定了亚端粒中存在的三个主要重复元素，我们称之为 Sultan、Subtile 和 Suber，以及三个染色体末端，核糖体 DNA 作为其亚端粒的唯一识别成分。最常见的结构存在于 34 个亚端粒中的 27 个，是与端粒相邻的Sultany element的异色阵列，其次是转录的间隔序列、富含 G 的微卫星和转座元件。序列相似性分析表明，Sultany element在每个亚端粒内都经历了节段重复，并以低得多的频率在亚端粒之间重新排列。对其他绿藻的分析揭示了在亚端粒之间共享的物种特异性重复元素，其整体组织类似于莱茵衣藻。这项工作揭示了绿藻中亚端粒结构的复杂性和演变。在大多数真核生物中，亚端粒是由不同来源的多拷贝序列构成的动态基因组区域，可以促进片段复制和染色体重排。然而，它们的重复性揭示了不同绿藻之间在亚端粒之间共享重复元素，其整体组织类似于莱茵衣藻。这项工作揭示了绿藻中亚端粒结构的复杂性和演变。 

原文链接：Architecture and evolution of subtelomeres in the unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii

https://doi.org/10.1093/nar/gkab534