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缺氮胁迫下莱茵衣藻脂质积累过程中MicroRNA表达谱分析
日期: 2022-02-18     查看次数: 235

 

Bioengineering (IF=4.530) 2021-12-27

中国科学院上海高等研究院 张保国课题组

目前研究已证实了缺氮可以诱导微藻的脂质积累,它控制着细胞内多种基因的表达。然而,这种现象的潜在分子机制在很大程度上仍然是未知的。MicroRNA(miRNAs)在转录后基因调控中起着重要作用。在本研究中,我们提出,假定miRNA参与了缺氮引起的微藻脂质积累过程。通过深度测序平台,我们探讨了莱茵衣藻在缺氮条件下miRNAs介导的反应。miRNA对缺氮条件反应的预测靶基因中,真核生物同源蛋白簇(KOG)的功能主要涉及细胞基因转录、脂质转运和代谢等信号转导机制。我们共得到109个预测miRNA,包括79个已知miRNA30个新miRNA。其中有29microRNAs在缺氮后检测到其表达有显著差异,且多呈上调现象。有10microRNAs及其靶向基因可能参与脂质转运和代谢生物学过程。本研究首次探讨了缺氮条件对微藻microRNAs的调控作用,并为microRNAs在微藻脂质积累中的重要性提供了新视角。本研究为微藻在生物油工程生产中的应用提供了理论指导。

原文链接:MicroRNA Expression Profile Analysis of Chlamydomonas reinhardtii during Lipid Accumulation Process under Nitrogen Deprivation Stresses.

https://doi.org/10.3390/bioengineering9010006

 

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