Applied Microbiology and Biotechnology (IF = 3.530) 2021-10-20
华中农业大学 陈雯莉课题组
甲基紫对生物的毒性主要源于由生物氧化应激产生的活性氧。本文研究了Synechocystis sp. PCC 6803被甲基紫处理后的转录组与代谢组。通过转录组测序,我们发现了许多响应甲基紫胁迫的基因,并利用WGCNA方法进行了深入分析。同时在代谢组中也发现了许多代谢物在甲基紫处理后有所变化。基于对差异表达基因和差异代谢物的KEGG分析,我们分析了十个相关的代谢通路中的基因与代谢物的变化情况。结果表明尽管甲基紫的最强氧化胁迫在6 h,相关上调基因以及代谢物在此时比例最高。光合作用正向调控细胞对甲基紫氧化胁迫的响应,而甲基紫引起的氧化胁迫抑制了环境信息加工的调控。其他代谢途径在不同的时间点发挥了不同的作用,并相互作用以响应甲基紫。本研究通过多组学方法,分析了Synechocystis sp. PCC 6803对甲基紫引起的氧化胁迫的响应。为后续深入分析生物对甲基紫,特别是光合生物对甲基紫的响应提供了关键数据和重要信息。
原文及链接:
Transcriptome and metabolome analyses of response of Synechocystis sp. PCC 6803 to methyl viologen
https://doi.org/10.1007/s00253-021-11628-w