BMC Genomics (IF=3.969) 2020-07-11

中国科学院南京地理与湖泊研究所 史小丽课题组

超微型浮游植物在富营养化湖泊中数量丰富，是主要的初级生产力。Mychonastes物种是富营养化湖泊中常见的真核浮游植物。该研究使用第三代测序技术对从中国富营养化淡水湖巢湖中分离出的Mychonastes homosphaera的全基因组进行测序。M. homosphaera的基因组大小为24.23 Mb，包含了6649个蛋白编码基因，比密切相关的 Sphaeropleales 物种的基因组更紧凑。这种基因组精简可能是由基因家族数量、基因间大小和内含子的减少引起的。M. homosphaera的基因组序列揭示了该生物在富营养化湖泊中适应环境所采用的策略。对培养物和蛋白质补体的分析突出了 M. homosphaera 代谢的灵活性，其基因组编码了参与光收集、碳水化合物代谢以及氮和微量元素代谢的基因，其中许多形成功能基因簇。M. homosphaera的生物能量代谢途径（例如脂质、淀粉和类异戊二烯途径）的重建证明该物种可被用来生产生物燃料。综上所述，M. homosphaera的全基因组分析提供了对基因组精简、高脂质产量、环境适应和浮游植物进化的见解。

原文链接：Genome analyses provide insights into the evolution and adaptation of the eukaryotic Picophytoplankton Mychonastes homosphaera

https://doi.org/10.1186/s12864-020-06891-6