Nature Ecology & Evolution (IF=15.460) 2020-06-22
深圳华大生命科学研究院 刘欢课题组
基因组分析微型真核海洋绿藻 Prasinoderma Colonile CCMP 1413揭示了绿色植物中存在一个新的门,即华藻门(Prasinodermophyta),它在绿藻门和轮藻门分裂之前就已经分化出来。基因组和基因家族的结构特点比较,揭示了P. coloniale基因组(25.3 Mb)介于极其紧凑、小型的微型浮游 Mamiellophyceae(绿藻门)基因组和较大、更复杂的早期分化的轮藻基因组之间。绿色植物科的最小核心基因组的重建可以识别祖先工具包中的转录因子的鞭毛蛋白。P. coloniale对其所处深水、寡营养环境的适应性与光捕获蛋白的扩展、早期光诱导蛋白的减少、独特类型的C4光合作用和碳浓缩机制、金属络合代谢物吡啶甲酸的合成和维生素B1、B7、B12的合成缺陷等有关。综上所述,P. coloniale基因组为绿色植物进化提供了新的见解。
原文链接:The genome of Prasinoderma coloniale unveils the existence of a third phylum within green plants
https://doi.org/10.1038/s41559-020-1221-7